La plupart des produits chimiques en nature n'ont aucune couleur. La chose qui donne à quelque chose une couleur est la manière qu'elle absorbe la lumière. Les produits chimiques sont l'opposé de couleur de la couleur qu'ils absorbent. L'absorption de couleur se produit par une interaction complexe de l'énergie de vibration des électrons qui implique la théorie de quantum et le beaucoup de maths dures. Quand la phénol-phtaléine est dans la solution basique (par opposition à la solution acide) un couple des hydrogens est retiré sa structure moléculaire de telle manière qu'un anneau des atomes de carbone s'ouvrent pour créer ce qui s'appelle une structure en esclavage fortement conjuguée dans la molécule. Cela signifie que la chaîne des atomes de carbone composant la molécule de phénol-phtaléine alternent avec le lien simple et les raccordements de lien double entre chaque carbone. Cet alterner simple, double, simple, double système de liaison a souvent comme conséquence la couleur parce qu'il crée les conditions qui donnent juste les bonnes vibrations aux électrons ainsi elles absorbent l'énergie dans la partie plutôt étroite du spectre électromagnétique que nous des humains pouvons voir. Pour plus de détail, il y a une grande explication à la chimie générale en ligne.